Au deuxième niveau, il y a le Conseil général (composé normalement des
ambassadeurs et des chefs de délégation en poste à Genève, mais parfois
aussi de fonctionnaires envoyés par les capitales des pays Membres), qui se
réunit plusieurs fois par an au siège de l’Organisation à Genève. Le Conseil
général se réunit aussi en tant qu’Organe d’examen des politiques
commerciales et en tant qu’Organe de règlement des différends.
Au troisième niveau, il y a le Conseil du commerce des marchandises, le
Conseil du commerce des services et le Conseil des aspects des droits de
propriété intellectuelle qui touchent au commerce (ADPIC), qui rendent
compte au Conseil général.
De nombreux comités spécialisés, groupes de travail et groupes d’experts
s’occupent des domaines visés par les différents accords et d’autres
domaines tels que l’environnement, le développement, les demandes
d’accession et les accords commerciaux régionaux.